慢性软组织损伤引起的主要方式可总结为三个方面：
一是运动性损害：具体体现为急性暴力型损伤造成的减速性损害、慢性积累性损伤造成的加速性损害两种，一般都具有明显的暴力性损伤史或职业、习惯等的慢性劳损史，临床诊断相对比较明确。

二是静力性损害：该型损害起病较为隐蔽，主要是由于软组织在运动极限范围内的过度性使用造成，实质上也是一种运动性损害，一般可一次致病(如落枕)，也可多次反复造成（如肩周睡眠型肌群损伤或可称为类肩周炎），为了形象的说明这类损害，作者也一般将其称为橡皮筋损伤，就是将一根橡皮筋在极限状态下持续过度牵拉而一次性造成的损害，临床表现为两类病患，即起止点的应力性骨膜肌腱炎和肌腹部的残余胀力性肌纤维炎。

三是肌营养不良和激素代谢紊乱性损害：肌营养不良是指肌肉正常新陈代谢过程中所需的各种营养物质的缺乏不足、过度消耗，或偏嗜偏多、过度堆积等所造成的发育性、消耗型疾患；激素代谢的波动紊乱，由于影响了蛋白的合成，使骨、肌肉、韧带强度、韧性下降变化，本身在临床上会造成软组织与骨关节多种形式的直接损害。

以上损害形式的终极表现均可体现为舒针疗法中提出的十大病理表现形式和肌肉短缩学说。因此，舒针疗法认为，慢性软组织损伤的根本原因和病理基础就是肌肉短缩畸形。